Всё, что мы узнали о генетике, но не успели понять

[Okarin]

Мусорная ДНК - это зачастую репетитивная ДНК

Не поясните, что есть репетитивная ДНК? Желательно в контексте проблем его инактивации.
И еще вопрос - таки зачем нужна мусорная ДНК? Или это просто в некотором роде мёртвый груз?

[Германец]

Okarin

Не поясните, что есть репетитивная ДНК? Желательно в контексте проблем его инактивации.

Здесь две главные проблемы - общая величина мусорной ДНК и ее репетитивность.

Репетитивная ДНК - это иногда до несколько десятков кб повторяющихся коротких секвенций между генами. Тоесть, там, согласно повторяемости, будут в лучшем случае наличествовать одни и те же палиндромы - потенциальные места расщепления. А это значит, что расщепить Вы <<мусор>> расщепите, но не специфично в одном месте, а черт-ти знает хде. И посему результат будет неоднозначен, поскольку будет иметь множество неких потенциальных причин. А цель - найти только одну - искомую. Повторите Вы расщепление подобным образом, то вероятность того, что Вы расщепите в тех же местах, как и в первом эксперименте, опять же будет мала. Тоесть, Вы по всей вероятности получите немного иной результат, но возможно, уже со своим множеством причин. Но скорее всего, что практически всегда и случается, эта новая модифицированная линия не даст никаких отличий в фенотипе по отношению к wt. А отличия как раз и показывают - ага! - <<до>> имелся такой фенотип, а <<после>> иной, значит мы <<ткнулись>> в нужное место.

Тоесть, методика кнок аута генов на репетитивке не работает, ибо там в большинстве случаев нет специфики в секвенции, которая присутствует в генах. А вслепую в мусоре ковыряться, сами понимаете, никакого смысла нет. Именно поэтому для некой <<подозрительной>> секвенции, находящейся в рамках мусорной ДНК, прежде всего необходимо иметь реальные предпосылки, что она может быть за что-то отвечает. А сие достигается сравнением сей секвенции с уже известными, но из других родственных организмов. Тоесть, ищется хоть какая-либо гомология, за что можно так сказать уцепиться. Ну, и поскольку репететивной ДНК - океан по сравнению общей длиной <<немусорной>> ДНК, то и прочесывать все это добро специально - есть пока дохлый номер. К этому плюсуйте потраченное время на создание мутанта, чтобы получить результат, который наверняка не даст никаких отличий или наоборот, даст уйму возможных причин, которых потом ищи свищи.

И еще вопрос - таки зачем нужна мусорная ДНК? Или это просто в некотором роде мёртвый груз?

По тематике мусорная ДНК я уже писала небольшую лекцию http://www.evangelie.ru/forum/t94495-2.html#post3190747

[Okarin]

Okarin

Не поясните, что есть репетитивная ДНК? Желательно в контексте проблем его инактивации.

Здесь две главные проблемы - общая величина мусорной ДНК и ее репетитивность.

Репетитивная ДНК - это иногда до несколько десятков кб повторяющихся коротких секвенций между генами. Тоесть, там, согласно повторяемости, будут в лучшем случае наличествовать одни и те же палиндромы - потенциальные места расщепления. А это значит, что расщепить Вы <<мусор>> расщепите, но не специфично в одном месте, а черт-ти знает хде. И посему результат будет неоднозначен, поскольку будет иметь множество неких потенциальных причин. А цель - найти только одну - искомую. Повторите Вы расщепление подобным образом, то вероятность того, что Вы расщепите в тех же местах, как и в первом эксперименте, опять же будет мала. Тоесть, Вы по всей вероятности получите немного иной результат, но возможно, уже со своим множеством причин. Но скорее всего, что практически всегда и случается, эта новая модифицированная линия не даст никаких отличий в фенотипе по отношению к wt. А отличия как раз и показывают - ага! - <<до>> имелся такой фенотип, а <<после>> иной, значит мы <<ткнулись>> в нужное место.

Тоесть, методика кнок аута генов на репетитивке не работает, ибо там в большинстве случаев нет специфики в секвенции, которая присутствует в генах. А вслепую в мусоре ковыряться, сами понимаете, никакого смысла нет. Именно поэтому для некой <<подозрительной>> секвенции, находящейся в рамках мусорной ДНК, прежде всего необходимо иметь реальные предпосылки, что она может быть за что-то отвечает. А сие достигается сравнением сей секвенции с уже известными, но из других родственных организмов. Тоесть, ищется хоть какая-либо гомология, за что можно так сказать уцепиться. Ну, и поскольку репететивной ДНК - океан по сравнению общей длиной <<немусорной>> ДНК, то и прочесывать все это добро специально - есть пока дохлый номер. К этому плюсуйте потраченное время на создание мутанта, чтобы получить результат, который наверняка не даст никаких отличий или наоборот, даст уйму возможных причин, которых потом ищи свищи.

И еще вопрос - таки зачем нужна мусорная ДНК? Или это просто в некотором роде мёртвый груз?

По тематике мусорная ДНК я уже писала небольшую лекцию http://www.evangelie.ru/forum/t94495-2.html#post3190747

Благодарю, стало понятнее. Но я правильно понимаю, что мутации в мусорной ДНК практически не влияют на фенотип?

[Германец]

Okarin

Благодарю, стало понятнее.
Пожалуйста.

Но я правильно понимаю, что мутации в мусорной ДНК практически не влияют на фенотип?
Именно. Ну, разве что мутация случайно не активирует какой-нибудь псевдо-ген, тусующийся в мусорной ДНК.

[diana]

Все не так просто, как кажется. Мусорная ДНК - это зачастую репетитивная ДНК. В то время, когда ген или некий регуляторный компонент можно достаточно легко инактивировать, разщепив его (и да, даже гены из генома не УДАЛЯЮТСЯ, а инактивируются), то с мусорной ДНК такой фокус не пройдет.

Кроме того, поиски секвенций в мусорной ДНК, потенциально отвечающих за что-либо (кроме уже известных) - это как иголку в миллионе стогов сена искать. Если так, иногда случайно нарвешься, то поковыряться можно. А пока приоритет один - изучение генов.

А что если какой-то маленький такой типа компьютер, внедрить туда, где ему удобно было бы следить за сосотянием ДНК, - который бы считывал и учитывал, мусороные ДНК, рассортировывал их и автоматически удалял мусор?..

[Al Tair]

А что если какой-то маленький такой типа компьютер, внедрить туда, где ему удобно было бы следить за сосотянием ДНК, - который бы считывал и учитывал, мусороные ДНК, рассортировывал их и автоматически удалял мусор?..

Не в этой жизни.

[diana]

Не в этой жизни.

А есть сейчас в организме человека, хотя бы подобие такого чего-то, что - управляет ДНК и мозгом и всеми системами, откуда идёт - ЦУ?..

[Okarin]

А есть сейчас в организме человека, хотя бы подобие такого чего-то, что - управляет ДНК и мозгом и всеми системами, откуда идёт - ЦУ?..

Нет. ДНК сами по себе являются управляющим механизмом, которые управляют поведением отдельных клеток, а мозг управляет поведением на более высоком уровне - всего тела.

[diana]

Нет. ДНК сами по себе являются управляющим механизмом, которые управляют поведением отдельных клеток, а мозг управляет поведением на более высоком уровне - всего тела.

А так чтоб всем организмом что-то управляло и ДНК и мозгом, и др., такого - нет.. Понятно.. Всё управляется своими ЦУ, а единого руководства нет.. И как это такое возможно и организм еще остается в живых, после такого разобщения?..

[Okarin]

А так чтоб всем организмом что-то управляло и ДНК и мозгом, и др., такого - нет.. Понятно.. Всё управляется своими ЦУ, а единого руководства нет.. И как это такое возможно и организм еще остается в живых, после такого разобщения?..

А с чего бы ему умирать?

[Al Tair]

А есть сейчас в организме человека, хотя бы подобие такого чего-то, что - управляет ДНК и мозгом и всеми системами, откуда идёт - ЦУ?..

Человек не оборотен, сознательно перекидываться не может.
Нет никакой высшей силы и единого центра.ДНК мутирует в случайном порядке по целому ряду объективных причин.Наиболее удачные мутации с полезными свойствами закрепляются.Неудачные выводятся из оборота.Только не подумайте,что какими либо высшими силами выводятся. Отбор все решает.Или жизнестокость,если этот термин вам более понятен

[Алексей Ивин]

А так чтоб всем организмом что-то управляло и ДНК и мозгом, и др., такого - нет.. Понятно.. Всё управляется своими ЦУ, а единого руководства нет.. И как это такое возможно и организм еще остается в живых, после такого разобщения?..

Вот по этой то причине вы и топчетесь на месте,потому что у вас в мозгах нет руководства,а в Днк есть руководство,иначе бы ничего не менялось в природе,а был бы Хаос.

[Al Tair]

А так чтоб всем организмом что-то управляло и ДНК и мозгом, и др., такого - нет.. Понятно.. Всё управляется своими ЦУ, а единого руководства нет.. И как это такое возможно и организм еще остается в живых, после такого разобщения?..

Это называется-синергетика.Соединение разобщенных систем.Каждая система не может существовать индивидуально.Но все вместе образуют жизнестойкий организм. Примерно как автомобиле. У каждой системы разные функции.Но собраные вместе, - единый механизм для передвижения.

[Al Tair]

Вот по этой то причине вы и топчетесь на месте,потому что у вас в мозгах нет руководства,а в Днк есть руководство,иначе бы ничего не менялось в природе,а был бы Хаос.

А в природе и так хаос.Только упорядоченный

[diana]

А с чего бы ему умирать?

Ну как же.. Когда нет слаженности в действиях.. Мозг говорит одно, ДНК - другое, сердце - третье, что там ещё гипоталамус, гипофиз и т.д.. гормоны бал правят )))))) как так может жить человек?..